二氧化氯对水中传播的病原微生物,包括病毒、芽抱以及水路系统中的异氧菌、硫酸盐还原菌和真菌均有很好的杀灭效果,特别是对大肠杆菌的处理效果更为突出。其机理是：二氧化氯通过吸附和透过细胞壁,有效氧化细胞壁内含琉基的酶,并可快速控制微生物蛋白质的合成。
根据权威机构相关的测试结果表明,二氧化氯可以杀灭五十多种病毒和细菌。包括猪霍乱沙门菌、猪传染性胃肠炎病毒、香港禽流感A、禽流感、金黄色葡萄球菌、腺病毒（引起呼吸系统感染）、爱滋病毒、乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、疙疹病毒单一和单二型、人体冠状病毒、牛痘、狂犬病病毒、伤寒杆菌、鼠伤寒沙门氏菌等等。仅通过五分钟的接触时间,杀灭率即可达99.9%以上。
在年非典期间二氧化氯对SARS病毒的传播起到了重要的控制作用。在年禽流感期间,采用20mg/L二氧化氯与高致病禽流感的H5N1和H9N2亚型病毒直接接触5min,杀灭率达%。包括年出现的甲型H1N1流感病毒,二氧化氯都能很快将其杀死。
实验证明二氧化氯在控制病毒传播方面的效果十分明显。尤其是通过水体进行传播的病毒,效果更加明显。由此可见,二氧化氯是目前使用的化学消毒剂中最理想的杀菌消毒剂。
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