副猪嗜血杆菌血清型众多，耐药性极强。往往与蓝耳、圆环、支原体发生混感，临床上给防控该病带来巨大挑战。一般抗菌药物治疗效果均不理想。
现目前大部分用头孢噻呋钠、氟苯尼考与喹诺酮类药物连用进行控制该病。但这些药物都逐渐产生了耐药性，临床必须大剂量注射。
现目前临床治疗该病最为敏感的为甲磺酸达氟沙星、头孢喹肟（第四代头孢）。由于原料价格昂贵，为一般抗生素10倍以上价格。经体外抑菌试验表面：甲磺酸达氟沙星目前对胸膜肺炎、副猪嗜血杆菌极其敏感，显著优于氟苯尼考及头孢噻呋钠的临床疗效。
武当特攻（甲磺酸达氟沙星注射液），达氟沙星目前价格昂贵，为氧氟沙星原料价格的15倍，目前在兽医临床应用极少，耐药性极低。在治疗胸膜肺炎、副猪、链球菌具有显著疗效。可与克林新混合注射。作为重症急救的必备之药。考虑到副猪治疗中产生大量内毒素及高热问题，另侧再注射武当冰点（氟尼辛葡甲胺注射液）+精瑞特(0.5g头孢噻呋钠)混合注射斤体重。
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