真菌性皮肤病也叫皮肤癣菌病，主要是由真菌引起的毛杆和角质层感染，包括犬小孢子菌引起的钱癣、马拉色氏菌性皮炎，念珠菌病、孢子丝菌病、隐球菌病、组织胞浆菌病等等，猫比犬常见，幼龄犬猫和免疫力低下犬猫易感，狗的发病率较低。
不同的真菌引起的皮肤病症状也不同，譬如小孢子真菌引起的皮肤病变主要是铜钱样掉毛、皮屑、瘙痒，有的犬有红斑，有的没有，严重的病灶会化脓，叫作脓癣；马拉色氏菌是健康动物体表一种常见的真菌，大多数耳道真菌感染属于马拉色感染，当动物抵抗力下降的时候会导致自发式全身感染，表现症状主要是皮肤颜色变深，掉毛，轻度瘙痒，皮肤发臭。
不同的真菌诊断方法也不一样，对于钱癣可以用Woods灯检查，50%的小孢子菌感染会呈阳性反应；其次要做皮肤细胞学检查，可以发现小孢子和菌丝；进行毛发形态检查，发现毛干内外的小孢子；用DTM培养基进行真菌培养，判断真菌种类；进行活组织检查。
治疗1：对于局限性病例（比如局限的钱癣），剃毛和局部治疗之关键。可以采取局部大范围剪毛（外周边缘离开病变周围6厘米以上），局部大范围使用抗真菌药膏剂或水剂，比如洗必泰软膏，10%克霉唑软膏，2%酮康唑，特比奈芬软膏等等，12小时一次，直到病变消退后再用1周；糖皮质激素不建议使用，除非很严重的局部感染。
2：对于局部多处病变或者全身性病变以及局部病变用药效果不理想的动物，需要全身剃毛，使用抗真菌药全身治疗，可用药物有灰黄霉素、酮康唑口服、伊曲康唑，特比奈芬等口服，剂量和用药种类与动物年龄、怀孕与否有关，每24小时一次，至少4--6周，直到真菌检查阴性后，再坚持用药3--4周。
3：顽固性病例应该配合药用真菌浴液全身或局部洗浴，一方面可以减少皮肤病原体数量，另外可以起到全身治疗的作用，但每次洗浴时间不少于15--20分钟。
4：小孢子灭活疫苗在猫可以起到辅助治疗作用，但单独使用很少有效。
5：如果家养多只宠物或养殖场，在治疗已感染动物期间，对未感染动物进行隔离，预防性给药，用抗真菌药物进行洗浴，每周一次。
6：及时清扫环境，用真空吸尘器或消毒剂彻底处理环境。
7：皮肤真菌可以感染其他动物和人，尤其是家中有小孩，需要注意避免接触。
8：总的来说预后良好，除非患免疫抑制性疾病动物预后不良。
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