EM（EffectiveMicroorganisms）是日本琉球大学比嘉照夫教授等人研究成功的一种新型复合微生物活菌制剂，主要由光合细菌、乳酸菌、放线菌、发酵型丝状菌等5科10属80余种微生物组成，是一种厌氧性与好氧性兼有的特殊菌群。中国自20世纪90年代初引进EM技术，经过十几年的研究和推广应用，在种植业、养殖业和环境保护等领域已产生显著的社会效果和经济效益，呈现出良好的应用前景。EM含有多种放线菌，可分泌抗生物质，抑制有害微生物，尤其是病原菌和腐败细菌的活动。EM对多种植物病害如草莓根腐病、茎腐病、水稻立枯病、小麦全蚀病等都有明显的防治效果，对因灰霉菌引起的草莓根腐病的防治效果可达85%以上。
苹果树腐烂病是一种毁灭性果树病害，在北方苹果产区严重发生。此病的症状主要有溃疡型和枝枯型。溃疡型发病初期病部红褐色，稍隆起，组织松软，有酒糟味，常流出黄褐色汁液。后期病部失水下陷，长出黑色小点（分生孢子器），雨后小黑点上溢出金黄色的丝状或馒头状的孢子角。枝枯型多发生在2～4年生小枝上。病部扩展迅速，常呈现黄褐色与褐色交错的轮纹状斑。春季发病的枝枯型斑，病部以上枝条很快干枯，后期病部也长出许多黑色小粒点。
如何利用EM微生物环境改良剂（EM-农业种植专用型）高效防治苹果腐烂病？一年中任何时候，在巡查果园中只要发现腐烂病病斑，就要及时处理，越早越好。
一、首先刮除病斑:
EM-农业种植专用型菌液稀释30～40倍（注意：1斤EM-农业种植专用型菌液稀释29～39斤水，充分搅拌均匀），再用适量新土或充分腐熟的农家肥和成菌泥，涂抹覆盖病斑2厘米厚度，最后用塑料条包扎，来年春季即可显示神奇的效果。采用EM微生物环境改良剂菌泥防治苹果腐烂病，可有效控制病斑复发，促进伤口愈合。
杨凌职业技术学院马志峰、西北农林科技大学园艺学院王荣花等在年和年在陕西省眉县苹果园进行了苹果树腐烂病的防治研究。设EM活性菌泥30倍涂抹、EM活性菌液40倍涂抹、40%福美砷可湿性粉剂50倍液刮涂和对照（只刮除腐烂病疤,不涂药)4个处理，3次重复。结果表明，EM活性菌泥在防治效果、病疤复发率和促进病疤愈合效果方面均优于其它处理，其当年和第二年4月的防治效果分别为92.7%、93.5%,病疤复发率分别为1.8%、2.8%，促进病疤愈合效果也最好(50.4%)。因此，作者提出，将EM活性菌融入粘泥载体中制成菌泥，涂抹在腐烂病疤上，以菌治菌是防治苹果树腐烂病的新途径（详见《中国农学通报》第23卷，年，第12期，～页）。
二、用EM生产有机生物肥料：
每吨未腐熟的有机肥，用EM-农业种植专用型菌液5升，分两次兑水稀释公斤。先用其中公斤稀释液细致喷洒处理的有机肥，充分搅拌均匀，然后封闭发酵（可用塑料布或泥土密封）7～10天（因大型养鸡场的鸡粪内含抗生素，需10天以上），即厌氧处理；接着开始有氧发酵处理，再用剩余的公斤EM-农业种植专用型菌液稀释液细致喷洒，充分搅拌均匀，这次不需要封闭（有氧处理），但需每2天左右搅拌1～2次，共需搅拌4～5次，待其充分腐熟即成有机生物肥料。
秋季是使用高效EM微生物环境改良剂的最好时机，这是因为我国的黄土高原苹果产区地处干旱半干旱地区，年降水时空分布不均，九月份是每年的降雨集中期，加之秋高气爽，温度合适，特别有利于生产生物有机肥。
栽培防病是综合防治苹果腐烂病的基础。要加强土肥水管理，施足有机肥，增施磷钾肥，避免偏施氮肥；控制负载量；合理修剪，克服大小年；清除病源；实行病疤桥接。
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