如果对虾感染微孢子虫病，会让对虾出现发育不良和生长缓慢，严重的情况之下，死亡率会迅速上升，1-2周内虾的死亡率达到60%-70%，如果疾病继续加重，虾的死亡高达%。
一、病原体
最初一些养虾场调查的病原体（微孢子虫），被确定为属于孢子纲、微孢子门、小孢子虫属，根据相关的研究显示：微孢子虫感染的面很广，主要寄生在细胞内。并且，从80年代开始，人们开始意识到微孢子虫可以引起感染，并可引起微孢子虫病。下面这张图（图1），是斑节对虾肝胰腺细胞的细胞质中捕获成年孢子。
图1：斑节对虾肝胰腺中的成熟孢子（革兰氏染色）
电子显微镜图像显示，成熟的孢子纵切面呈椭圆形，尺寸-()x-()nm，孢子壁厚35-90(61)nm。前面有一个囊状极（PP），前面有一个附着盘（ad），后面有一个液泡（PV），中间有一个核（N），囊肿两侧有5个丝状环（pf）。孢子阶段主要在宿主细胞质（肝胰腺细胞）中发育，在含有许多小颗粒（bleb）的宿主细胞表面上。
图2：孢子沿椭圆形切开，前面有囊状极（PP），前顶端是附着盘（ad），后面是液泡（PV），中间有核（N），两侧杆上有5个丝状环(pf)（HKHVT-采集的样本）。
二、感染微孢子虫的病理体征
感染特征：病虾活动缓慢，很多聚集到池塘边缘，虾死亡率迅速增加，1-2周内虾死亡60%-70%，如果病情严重可死亡可高达%。
外部体征：病虾没有特定的疾病症状，通常出现生长缓慢和粪便（图3A，B）。
体内特征：严重时，对虾肝胰腺严重坏死（变形），但是对虾轻度感染，体内无明显特征。当虾经历虚弱死亡之后，肝胰腺会很快腐烂。
组织病理学体征：肝胰管模型多为坏死（空心）并含有许多脂肪滴（图4.5）。扩大的肝胰腺小管中的一些细胞充满了小的、分化的细胞核（图6）。
图3A：生长缓慢的虾，分群。图3B：虾生长迟缓，粪便不正常。
图4A：斑节对虾肝胰腺细胞中的成熟孢子，充满了小颗粒的分化核。
图4B：斑节对虾肝胰腺中的成熟孢子
图5A：对虾肝胰腺已经坏死。
图5B：肝胰管细胞扩大，并开始分化。
三、疾病的分布和传播
对病池商业化养殖的斑节对虾肝胰腺样本进行分析，组织病理学分析结果显示，微孢子（Enterocytozoonsp）的感染率为83.33%-.77%；在健康（正常）虾池中，前期微小孢子（Enterocytozoonsp）的感染率为0-28.33%，后期的感染率为19.44%。
商业斑节对虾养殖池在不同月份（从第一个月（养殖30天）到第四个月（90天），当虾出现生长迟缓、分化和死亡的迹象时，通过组织病理学检查，小孢子（Enterocytozoonsp）的感染率为92.14%-97.78%，部分池塘感染率为%。
22份斑节对虾肝胰脏样本电镜检测21份样本（95.45%）有不同形态的小孢子（Enterocytozoonsp）：成熟孢子、宿主细胞表面有许多小颗粒（Bleb）。从患病池塘采集的斑节对虾的肝胰腺样本中发现了微孢子，然后再采集了3个测试样本，发现2个样本带有微孢子。
分子生物学方法分析：PCR、WSSV、YHD试纸、组织病理学、虾类几乎没有常见的病毒性疾病（MBV、WSSV、YHD、BMN、HPV...），但是，分离细菌发现了弧菌属。
四、诊断
诊断方法不同：对病虾的组织病理学、电镜、分子生物学等可以确定病因主要为微孢子虫（Microsoporidia），比如：是否发现肠胞菌属、肠胞菌科、胞内寄生虫等。
五、疾病防治
微孢子属于胞内寄生虫群，它们的壳比较稳定，所以很难用药物治疗疾病，所以养殖虾的主要措施是预防疾病，如下：
-杀灭环境中的病原体：使用TCCA消毒片杀灭池塘底部和水环境中的病原体，使用微生物产品清洁环境，减少换水以防止病原体进入外部环境。如果需要换水，水源必须从经过沉淀池消毒之后，才可以进入池塘。
-虾类疾病预防：使用草药EKVARIN，剂量1ml/10kg虾/天，疾病治疗需要5-7天；每15天定期预防疾病，连续3天每天喂虾一次，这样可以提高养殖虾的抗病能力。
-虾肝胰腺坏死的修复：使用多种氨基酸、酶、多种维生素、多种微量营养素……，快速恢复养殖虾的肝胰脏。
