医院感染团队SIFIC感染官微收录于话题#感染性疾病的精准诊治8个
快速、准确的病原学诊断，能尽早选择敏感的抗感染药物或采取有效、具有针对性的防控措施，是感染性疾病精准化防治的核心。宏基因二代测序作为一种新兴的检测技术，能够不依赖微生物培养而检出临床样本中的所有微生物，该技术已在国内被广泛应用，并展现了其快速、无偏倚和高检出的优势。
《中国临床医学》杂志第27卷第4期特设立“感染性疾病精准诊治”专题报道，收录了医院“感染-感控-微生物”团队多篇相关文章，以8篇文章的全篇幅，整体展现了其在疑难复杂感染的病原诊断、医院感染防控中的意义。
SIFIC团队特此专栏报道，昨天已为大家带来两篇精彩文章，今天继续为大家带来《宏基因二代测序技术辅助诊断波氏假阿利什霉肺部感染1例报告》，医院感染团队为我们带来1例波氏假阿利什霉肺部感染的精彩诊断，希望您能从中获益。
宏基因二代测序技术辅助诊断波氏假阿利什霉肺部感染1例报告
作者：单玉璋，苏逸，姚雨檬，胡必杰
单位：医院检验科/感染病科
假阿利什霉属肺部感染影像学表现与曲霉属感染无明显差异，但药物敏感性不同，因此菌种鉴定对指导临床治疗意义重大。本研究报告1例有哮喘病史的老年女性病例，出现咳嗽、咳痰伴胸闷，影像学表现为肺部空洞，经痰微生物培养和宏基因二代测序技术诊断为波氏假阿利什霉感染。国内外尚无宏基因二代测序技术诊断此疾病相关报道，该病例旨在为其在肺部感染的诊治提供参考。
波氏假阿利什霉；肺部感染；宏基因二代测序技术
波氏假阿利什霉(Pseudallescheriaboydii)最早发现于年，既往被认为是尖端赛多胞(Scedosporiumapiospermum)的有性阶段，同属于赛多胞属。近年来随着DNA序列分析在微生物分子系统学的应用，尖端赛多胞和波氏假性阿利什霉被分为不同的种，并将后者的无性阶段称为波氏赛多胞(Scedosporiumboydii)。假阿利什霉复合群常见于土壤和污水中，对于免疫功能正常的个体，可在创伤或手术后引起局部感染；在免疫功能受损的个体中，引起严重的播散性疾病。呼吸道感染波氏假阿利什霉的首发症状常包括发热、咳嗽、咳痰、胸痛、呼吸急促等，其肺部感染影像学表现与曲霉属感染无明显差异。
由于假阿利什霉属和曲霉属对真菌的药物敏感性不同，因此菌种鉴定对指导临床治疗意义重大。常规微生物培养法是传统诊断的金标准，但需要几天甚至一周时间。近年来，随着诊断技术的快速发展，质谱鉴定和宏基因二代测序(metagenomicnext-generationsequencing，mNGS)技术成为辅助诊断感染性疾病的有效方法，能在48h内得到鉴定结果，缩短实验室检验周期的同时提高了临床对疑难感染的诊断效率。本研究首次对1例波氏假阿利什霉肺部感染病例采用mNGS和质谱辅助诊断，旨在为相关疑难感染提供新的诊断思路。
1、病例资料
1.1既往资料患者，女，74岁，4年前因小细胞癌行左肺上叶切除术，术后接受4周期化疗与28次放疗，末次放化疗于年6月结束，此后定期复查胸部CT。年10月出现咳嗽、咳黄痰，胸部增强CT示术区实变灶伴厚壁空洞并少量胸腔积液，使用头孢菌素治疗1个月无明显好转。年12月起患者症状加重，肺功能示重度阻塞性通气功能障碍，予布地奈德福莫特罗吸入，症状无明显缓解。年2月15日复查胸部CT，示左肺空洞灶较前增大，予以阿奇霉素0.5gqd间断口服，3月29日因症状进一步加重，收治入院。
1.2入院及治疗过程因“反复咳嗽、咳黄痰伴胸闷半年，加重4月”于年3月29日入院。患者入院后体格检查：体温36.3℃，脉搏84次/min，呼吸频率20次/min，血压/68mmHg；白细胞5.^9/L，血沉70mm/h，超敏C-反应蛋白48.9mg/L；免疫球蛋白IgEIU/mL，结核菌感染T细胞斑点试验(T-SPOT)A/B0/0，肿瘤标志物CAU/mL(＜10.0)；胃泌素释放肽前体、鳞癌抗原、甲胎蛋白、癌胚抗原、糖类抗原CA19-9、糖类抗原CA、前列腺特异抗原等均阴性；半乳甘露聚糖试验0.46μg/mL，烟曲霉IgG抗体.79AU/mL，烟曲霉IgＭ抗体＜31.25AU/mL；痰微生物培养未见致病菌生长；胸部CT(图1A、1B)示左肺术后改变，见斑片条索影，局部见空洞(箭头示)，内见气液平。考虑肺空洞病灶合并普通细菌感染不除外，予哌拉西林他唑巴坦3gq8h＋左氧氟沙星0.6gqd治疗4d。因患者要求出院，予带头孢地尼0.1gq8h＋左氧氟沙星0.4gqd口服抗感染。
图1患者治疗前后胸部CT扫描结果
A、B：入院时胸部CT；C、D：伏立康唑治疗49d后，胸部CT
1.3痰mNGS和常规微生物培养结果年4月4日，患者痰mNGS检测结果(4月2日送检)：少量波氏假阿利什霉(波氏赛多孢子菌)，属严格序列数5。同时痰微生物培养结果(3月31日送检)(图2)显示，SDA平板生长多个白色棉花状菌落，菌落背面呈褐色。酚棉兰染色及真菌荧光染色镜下，菌丝较粗、分隔，分生孢子卵圆形，单个着生于分生孢子梗顶端，符合典型的波氏假阿利什霉/尖端赛多胞复合物特征。采用梅里埃基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(ＭALDI-TOFＭS)(数据库3.0)鉴定为波氏假阿利什霉。
图2患者痰常规微生物培养结果
A：SDA平板培养4d，见多个白色棉絮状菌落；B：培养至7d，菌落变为灰色；C、D：采用酚棉兰染色，真菌荧光染色油镜观察，分生孢子梗及明显分隔，卵圆形分生孢子单个着生于分生孢子梗顶端.Origina1magnification：x
1.4治疗效果综合痰mNGS和培养结果，考虑肺部空洞病灶为波氏假阿利什霉感染所致，肺肿瘤合并波氏假阿利什霉感染不完全除外，告知患者病原学检查结果，并于4月11日起采用伏立康唑单药抗真菌治疗。4月18日复查痰培养(4月11日送检)仍提示波氏假阿利什霉生长。患者咳嗽、咳痰、胸闷有所好转，随访血沉及超敏C-反应蛋白好转，5月29日随访胸部CT(图1C、1D)示肺内病灶有所吸收。
2、讨论
波氏假阿利什霉是一种侵袭性较强的条件致病菌，假阿利什霉复合群在医学真菌学中常被鉴定错误，主要由于复合群内各种表型差异较大，可表现为与假阿利什霉完全不相关的属的形态。由于目前开展丝状真菌的药敏工作较为困难，临床一般根据丝状真菌的鉴定结果，结合天然耐药来决定治疗方案。近年来随着丝状真菌感染越来越受到临床
